改良版EOを用いた蛋白質立体構造アラインメント

URI http://harp.lib.hiroshima-u.ac.jp/hiroshima-cu/metadata/10443
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タイトル
改良版EOを用いた蛋白質立体構造アラインメント
別タイトル
Modified Extremal Optimization for Optimal Protein Structure Alignment
著者
氏名 中田 章宏
ヨミ ナカタ アキヒロ
別名 AKIHIRO Nakata
氏名 田村 慶一
ヨミ タムラ ケイイチ
別名 TAMURA Keiichi
氏名 北上 始
ヨミ キタカミ ハジメ
別名 KITAKAMI Hajime
氏名 三村 賢太
ヨミ ミムラ ケンタ
別名 MIMURA Kenta
氏名 高橋 誉文
ヨミ タカハシ シゲフミ
別名 TAKAHASHI Shigehumi
抄録

Extracting similar three-dimentional structures between proteins is one of the most important challenges for bioinformatics. The protein structure alignment is one of the most effective methods to extract similar three-dimentional structures of two proteins, and CMO(Contact Map Overlap) is formulated as a combinational optimization for the protein structure alignment. In this paper, we propose a novel heuristic for CMO problem using Modified-EO.

掲載雑誌名
2012 IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop Proceedings = 2012 IEEE SMC Hiroshima Chapter 若手研究会講演論文集
開始ページ
39
終了ページ
42
出版年月日
2012-07
出版者
IEEE SMC Hiroshima Chapter
本文言語
日本語
資料タイプ
会議発表論文
著者版フラグ
著者版
権利情報
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備考

2012 IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会, 2012年7月14日, 広島市立大学

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区分
hiroshima-cu